Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCAPHQ15003 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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