Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHROOM2Q13796 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
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