Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RUNX3Q13761 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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