Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CAMK2DQ13557 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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CAMK2DQ13557 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAMK2DQ13557 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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