Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD4Q13485 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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