Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF6Q13247 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms