Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPS1Q13098 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms