Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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