Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BNIP3Q12983 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BNIP3Q12983 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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