Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SSRP1Q08945 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms