Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
LRP1Q07954 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms