Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSME1Q06323 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms