Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPCQ03188 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms