Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms