Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms