Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX1P83916 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX1P83916 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBX1P83916 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBX1P83916 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBX1P83916 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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