Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms