Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN2P57739 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms