Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
EPHA4P54764 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHA4P54764 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms