Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HIRAP54198 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HIRAP54198 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
HIRAP54198 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HIRAP54198 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms