Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMSP52788 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMSP52788 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMSP52788 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMSP52788 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMSP52788 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMSP52788 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMSP52788 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMSP52788 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMSP52788 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMSP52788 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMSP52788 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMSP52788 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMSP52788 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMSP52788 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMSP52788 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMSP52788 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMSP52788 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms