Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SSR4P51571 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SSR4P51571 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SSR4P51571 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms