Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCA2P51531 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms