Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FNTAP49354 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FNTAP49354 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms