Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK1DP48730 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK1DP48730 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms