Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NESP48681 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NESP48681 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NESP48681 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NESP48681 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
NESP48681 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NESP48681 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NESP48681 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NESP48681 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NESP48681 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NESP48681 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms