Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM5CP41229 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM5CP41229 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms