Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN2P35609 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms