Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPHA2P29317 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPHA2P29317 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms