Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRDP23468 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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