Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC9A1P19634 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms