Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB9P17482 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB9P17482 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB9P17482 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB9P17482 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB9P17482 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB9P17482 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB9P17482 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB9P17482 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB9P17482 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB9P17482 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXB9P17482 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms