Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GATA1P15976 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GATA1P15976 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms