Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFTRP13569 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFTRP13569 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFTRP13569 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFTRP13569 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFTRP13569 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFTRP13569 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFTRP13569 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFTRP13569 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFTRP13569 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFTRP13569 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFTRP13569 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFTRP13569 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFTRP13569 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms