Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RARBP10826 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RARBP10826 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RARBP10826 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RARBP10826 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RARBP10826 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RARBP10826 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RARBP10826 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RARBP10826 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RARBP10826 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RARBP10826 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RARBP10826 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms