Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRR35P0CG20 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms