Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPN2P04844 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPN2P04844 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPN2P04844 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPN2P04844 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPN2P04844 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPN2P04844 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPN2P04844 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPN2P04844 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPN2P04844 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPN2P04844 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPN2P04844 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPN2P04844 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPN2P04844 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPN2P04844 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms