Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL18O94889 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms