Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF4O60810 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms