Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRTM2O43300 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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LRRTM2O43300 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRTM2O43300 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRTM2O43300 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRTM2O43300 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRTM2O43300 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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LRRTM2O43300 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRTM2O43300 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
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LRRTM2O43300 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRTM2O43300 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRTM2O43300 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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LRRTM2O43300 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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LRRTM2O43300 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRTM2O43300 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRTM2O43300 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRTM2O43300 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRTM2O43300 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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