Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NDUFS4O43181 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms