Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRT4C9JH25 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms