Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRAMEF25A6NGN4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms