Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms