Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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