Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HECTD4Q9Y4D8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms