Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZDHHC9Q9Y397 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZDHHC9Q9Y397 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms