Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED16Q9Y2X0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms