Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms