Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TTF2Q9UNY4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms